Il est recommandé d’éviter le contact avec toute déjection d’animaux puisqu’elles sont favorables aux micro-organismes. Cependant, l’ingestion d’un grain de guano par la bouche présente peu de risques car les sucs digestifs détruisent bon nombre de ces micro-organismes. Les odeurs de guano ou d’urines peuvent être désagréables mais il est peu probable que les doses respirées (faible concentration et durée) dans une habitation déclenchent des rhinites.